Ағжи умрининг 19 йил Италия қамоқхонасида, 6 йил Истамбул қамоқхонасида жазо муддатини ўтади. У 1981 йилда Рим шаҳрида Рим Папасига қарата ўқ узган ва уни ярадор қилган эди. 2000 йилда Италия ҳукумати Меҳмет Ағжини авф этди. Рим папаси Иоан Павел Иккинчи Ағжини кечириш учун қамоқхонага шахсан бориб уни зиёрат қилганди.
